肇庆医学院以肇庆医学高等专科学校为基础设置，性质为公办本科。成为广东目前唯一一所以“医学院”命名的高校。肇庆医学院学校标识码为4144013810，学校专业设置按教育部有关规定办理，首批设置护理学、药学等2个普通本科专业。

肇庆医学高等专科学校前身为创建于1958年的中山医学院肇庆分院。2004年，经教育部批准，升格为公办医学高等专科学校。目前，肇庆医学院有端州、鼎湖、肇庆新区3个校区，直属附属医院3所。其中第一附属医院（肇庆市第一人民医院）为三级甲等综合医院、广东省高水平医院；附属中医医院（肇庆市中医院）为三级甲等中医医院；附属口腔医院（肇庆市口腔医院）为二级甲等医院。校内开设临床医学、口腔医学、中医学等20个专业，形成了应用医学类、公共卫生类、健康服务类学科专业体系。其中，临床医学为国家级骨干专业。

在广东普通高考招生中，肇庆医学院投档分数一直居于高职高专院校的前10%。2024年春季高考数据显示，与2023年相比，2024年全部专业的最低录取排位上涨。